Iako se smatra osnovnim sredstvom lične higijene, brojna istraživanja pokazuju da toalet papir zapravo nije najhigijenskiji način održavanja čistoće nakon korištenja toaleta.

Papir uklanja samo površinske nečistoće, ali ne i bakterije, dok trenje može izazvati iritacije kože, pa čak i mikropukotine kroz koje bakterije lakše prodiru.

U mnogim zemljama svijeta, posebno u Aziji i na Bliskom istoku, prednost se daje pranju vodom pomoću bidea ili ručne tuš-pipe, što se smatra znatno čistijim i nježnijim rješenjem. Stručnjaci ističu da je voda efikasnija jer u potpunosti ispire nečistoće, dok papir samo djelimično čisti.

Zaključak: toalet papir jeste praktičan, ali ne i najhigijenskiji. Najbolje rješenje je kombinacija - blago pranje vodom, a zatim nježno sušenje papirom ili peškirom za jednokratnu upotrebu.