Prosinečki je u razgovoru za Gloriju rekao da su problemi počeli nakon prijateljske utakmice Španija - BiH.

- Moji problemi sa zdravljem počeli su 23. novembra 2018., dan nakon prijateljske utakmice Bosne i Hercegovine i Španjolske u Las Palmasu. Baš toga dana moja je starija kći Leonarda slavila rođendan pa sam bio sretan što ćemo napokon biti skupa. No probudio sam se s takvim groznim bolovima u trbuhu da nisam mogao hodati - kazao je Prosinečki za Gloriju, te dodao:

- Hitno sam prevezen u sarajevsku bolnicu gdje je nakon pretraga ustanovljeno puknuće debelog crijeva, što može dovesti i do sepse. Isti dan sam operisan, a nakon toga sam četrnaest dana proveo na odjelu intenzivne njege. Smršao sam 15 kilograma jer sam prvih deset dana primao samo infuziju.

Prosinečki je saradnju sa N/FSBiH raskinuo poslije neuspješnih kvalifikacija za Evropsko prvenstvo, a naslijedio ga je legendarni bh. trener Dušan Bajević.